Bão Marco hình thành từ một vùng áp thấp rộng tại khu vực tây bắc Carribe vào cuối tháng 9 năm 2008. Vào ngày 4 tháng 10, một sóng nhiệt đới di chuyển tới khu vực này, và hệ thống đã hình thành một tâm xoáy trên khu vực Belize. Sự hình thành của vùng thấp ban đầu bị cản trở do có khoảng cách gần với đất liền. Khi mà vùng thấp tiến gần tới Vịnh Campeche, các dòng đối lưu nhanh chóng hình thành xung quanh nó. Vào lúc 00:00 UTC ngày 6 tháng 10, vùng thấp được nâng cấp lên thành Áp thấp nhiệt đới Thirteen khi đang ở khu vực Laguna de Términos.[2] Một rãnh áp cao trung tầm ở phía bắc của áp thấp đã làm nó di chuyển theo hướng tây tây bắc. Các nhà dự báo cho rằng áp thấp này sẽ mạnh lên trước khi đổ bộ do nó đã hình thành một dòng khí di chuyển ra ngoài ổn định, và tồn tại một vùng gió đứt thấp cùng với nhiệt độ bề mặt biển cao trên đường đi chuyển của áp thấp.[3] Tới 12:00 UTC, áp thấp nhiệt đới được nâng cấp thành Bão nhiệt đới Marco, một xoáy thuận nhỏ với vùng mây rộng không quá 85 dặm (137 kilômét).[2]

Điều kiện thuận lợi giúp Marco nhanh chóng mạnh lên trong ngày 6 tháng 10. Đến sáng sớm hôm sau, Marco đạt cường độ mạnh nhất là 65 mph (105 km/h) và áp suất thấp nhất đạt 998 millibar (hPa; 29.47 inHg).[2] Các dữ liệu này có được nhờ một nhiệm vụ theo dõi bên trong Marco bằng máy bay, ghi nhận được sức gió tại độ cao của máy bay là 70 mph (110 km/h), tương ứng với vận tốc gió bề mặt là 61 mph (98 km/h). Sau khi mạnh lên nhanh chóng, các nhà dự báo để ngỏ khả năng Marco tiếp tục mạnh lên thành một bão cuồng phong trước khi đổ bộ đất liền.[4] Cơn bão duy trì một vùng nhỏ dòng khí đối lưu cao, có đường kính trung bình khoảng 9,2 dặm (14,8 km), và tiếp tục di chuyển theo hướng tây tây bắc.[5] Ngay sau khi đạt cường độ mạnh nhất, bán kính vùng gió mạnh của bão đạt 11,5 dặm (18,5 km) tính từ tâm bão.[6] Vào lúc 12:00 UTC, tâm bão Marco đổ bộ đất liền gần Misantla, Veracruz, với sức gió đạt 65 mph (105 km/h).[2] Sau khi đổ bộ, Marco nhanh chóng suy yếu,[7] và trở thành một áp thấp nhiệt đới 6 giờ sau đó. Vùng áp thấp nhỏ này đã tan sau đó cùng ngày trên vùng núi Mexico.[2]